Ex missione gesuita di evangelizzazione degli Indios guaraní, San Ignacio venne fondata nel 1610 nella regione di Guayrá e raggiunse la sua posizione attuale nel 1696. Durante il XVIII secolo annoverava una popolazione di circa 3000 abitanti. A partire dalla riscoperta del sito, nel 1878, un vasto progetto di restauro le ha reso parte del suo splendore. Il centro di interpretazione costituisce un'eccellente introduzione alla visita.