Dopo cinque anni di lavori, il museo ha riaperto le porte nel 2019 in spazi ristrutturati e in una nuova scenografia, più contestuale. Le opere provengono dal complesso monumentale di Piazza dei Miracoli. Spiccano le opere dello scultore Bonanno Pisano, autore della celebre Porta di San Ranieri nel transetto destro della cattedrale, di Nicola e Giovanni Pisano (busti della loggia del battistero), di Tino di Camaino e Nino Pisano, scultori di tombe. A Giovanni Pisano si deve anche la Madonna scolpita del Tesoro.