Questo convento domenicano, fondato alla fine del XV sec., fu residenza estiva dei Re Cattolici e sede dell'università. La chiesa (un'unica navata con due tribune) ospita il bel mausoleo d'alabastro dell'infante Don Juan, realizzato nel 1512 da Domenico Fancelli. I chiostri del Novizio (di estrema semplicità), del Silenzio (sufficientemente piccolo per il raccoglimento) e dei Re (museo di Arte orientale) conducono alla tribuna del coro e a quella dell'altar maggiore, che consente di ammirare da vicino il polittico di S. Tommaso, capolavoro di Berruguete.